Die PubMed-Homepage bietet Informationen über die Anzahl der darin enthaltenen Zitationen sowie Beispiele für die angebotenen Literaturarten und von welcher Stelle die Literatur gesammelt wird. Unter der Überschrift PubMed verwenden finden Sie Links zu einer Kurzanleitung, vollständigen Artikeln, häufig gestellten Fragen, Tutorials und einem Suchtool für klinische Studien. Zusätzliche Informationen auf der Homepage umfassen die Adresse des National Center for Biotechnology Information, U.S. National Library of Medicine.
Unter der Überschrift PubMed Tools befinden sich Links mit den Titeln PubMed Mobile, Single Citation Matcher, Batch Citation Matcher, Clinical Queries und Topic-Specific Queries. Die Überschrift Weitere Ressourcen bietet Links zur MeSH-Datenbank, zu den NCBI-Datenbankzeitschriften, den Entrez Programming Utilities-Programmen und LinkOut.
Die Überschrift "Erste Schritte" am Ende der Homepage enthält Links zum National Center for Biotechnology Information Education, einem NCBI-Hilfehandbuch und einem NCBI-Handbuch. Ein Link zu Schulungen und Tutorials ist ebenso verfügbar wie ein Link zum Einreichen von Daten.
Unter der Überschrift Ressourcen finden Benutzer Links mit den Titeln Chemikalien und Bioassays, Daten und Software, DNA und RNA, Domänen und Strukturen sowie Gene und Ausdrücke. Genetik & Medizin, Genome & Karten, Homologie, Literatur und Proteine sind weitere Links.
Die PubMed-Homepage bietet unten rechts einen Link zum Helpdesk. Unten links befindet sich ein Kontaktlink.