Ein Nonsense-Codon bewirkt, dass die Transkription von RNA oder DNA vorzeitig gestoppt und die effektive Synthese von Polypeptidketten verhindert wird. DNA funktioniert, indem sie die Anweisungen für die Proteinsynthese kodiert. Dies wird durch die zelluläre Maschinerie erreicht, die Aminosäuren zu langen Ketten zusammenfügt, die sich, wenn die Sequenz beendet ist, zu Proteinen falten. Ein vorzeitiger Stoppbefehl verkürzt den Prozess und verhindert die Synthese nützlicher Proteine.
Die genetische Maschinerie verwendet kurze Nukleotidsequenzen, um die Start- und Stoppstellen für die Transkription anzuzeigen. Zwischen diesen Start- und Stoppsignalen liegen die aktiven Gene, die für den Aufbau funktioneller Proteine kodieren. Gelegentlich verändert eine Einzelpunktmutation eine Sequenz in dieser Anleitung und wandelt einen kurzen Abschnitt von Nukleotiden in ein Stoppsignal wie TAG oder TAA um, das die Boten-RNA vorzeitig anweist, die Produktion einer Peptidkette zu stoppen und sie in ihrer unfertigen Form freizugeben Zustand.
Eine Analogie zu dem, was Nonsense-Codons tun, wären die Worte "das Ende", die in der Mitte eines Kapitels statt am Ende eines Buches erscheinen. Wenn der Leser den Anweisungen sklavisch gehorchen würde, wie dies bei mRNA der Fall ist, wäre die Geschichte nie zu Ende und die späteren Kapitel des Buches würden ungelesen bleiben. In der Zelle produziert dieser Unfall normalerweise nicht funktionierende oder "Unsinn"-Proteine, die ohne kritische Teile ihrer Struktur nicht funktionieren können.