Das Königreich Monera umfasste Bakterien und Cyanobakterien. Klassifizierungssysteme ändern sich, wenn Technologien wie die DNA-Sequenzierung neue Informationen über die Beziehung zwischen Organismen liefern. Ein Drei-Domänen-System bestehend aus Bakterien, Archaea und Eukarya verdrängte das Fünf-Königreich-System und Monera ist obsolet.
Ein funktionelles Klassifikationssystem unterteilt Organismen nach ihren Zelltypen und nicht nach ihrem Genom. Bakterien gehören zu den Prokaryoten, die sich durch das Fehlen eines Zellkerns und membranumhüllten Organellen in ihren Zellen auszeichnen. Die meisten Prokaryonten sind einzellige Organismen, die nur unter dem Mikroskop sichtbar sind. Eukaryoten umfassen Protisten, Pilze, Pflanzen und Tiere. Archaea sind Prokaryoten, die einige Eigenschaften mit Eukaryoten teilen, einschließlich ähnlicher Gene.
