Laut dem Penn State College of Agricultural Sciences ist der Hauptnachteil der Wasserenthärtung das potenzielle Gesundheitsrisiko für Personen, die sich natriumarm ernähren, da die Wasserenthärtung die Natriumaufnahme einer Person erhöhen kann. Außerdem ist weiches Wasser nicht zum Trinken geeignet. Da Metalle teilweise in Wasser löslich sind, werden beim Enthärten von Wasser Metalle viel aggressiver aus Wasserleitungen ausgelaugt.
Aquatechnologie erklärt, dass bei weichem Wasser eine hohe Wahrscheinlichkeit besteht, dass die anfängliche Entnahme von kaltem Wasser aus einem Wasserhahn einen überdurchschnittlichen Bleigehalt enthält. Daher darf kein enthärtetes Wasser aus dem Wasserhahn zum Trinken oder Kochen verwendet werden. Wasserenthärter sind nicht wirksam bei der Entfernung von Blei und anderen Metallen, Chlor und Chlornebenprodukten.
Außerdem weist Aquatechnology darauf hin, dass die Chloridkomponente der Natrium- oder Kaliumchloridverbindung in weichem Wasser schwerwiegende Auswirkungen auf die Flüssigkeitszufuhr von Menschen und Pflanzen hat, da Kalium und Chlorid den freien Wasserfluss in die Körperzellen einschränken. Die BBC weist darauf hin, dass enthärtetes Wasser nur zum Waschen von Kleidung verwendet werden sollte.
Wasserenthärter sind auch teuer im Betrieb, da sie bis zu 120 Gallonen für jede gelieferte 1.000 Gallonen verschwenden. Wartung ist ein anderes Thema. Das Penn State College of Agricultural Sciences gibt an, dass bei Modellen mit Sonderausstattung in der Regel für jedes zusätzliche Feature bezahlt werden muss.
