Zu den physikalischen Merkmalen Südostasiens gehören Bergketten, Ebenen, Halbinseln, Geraden und Inseln. Vietnam und Indonesien sind für ihre Gebirgszüge bekannt. Der höchste Berg Südostasiens ist der Hkakabo Razi in Myanmar mit einer Höhe von über 19.000 Fuß. Andere bemerkenswerte Merkmale sind das Tonle-Sap-Becken und das Mekong-Tiefland in Kambodscha. Auch die Inseln und Vulkane des malaysischen Archipels gehören zu Südostasien.
Die malaiische Halbinsel gehört zu Südostasien und umfasst die Länder Thailand, Singapur sowie Teile von Malaysia und Myanmar. Diese Halbinsel wird durch eine zentrale Bergkette geteilt, die den Mount Tahan umfasst. Flüsse fließen im Osten und Westen der Halbinsel. Der Pahang River ist bemerkenswert, da er mit einer Gesamtlänge von 271 Meilen der längste Fluss der malaiischen Halbinsel ist.
Viele Länder in Südostasien grenzen an den Ozean, daher gibt es in der Region mehrere Geraden, Golfe und Deltas. Dazu gehören die Straße von Malakka, die Straße von Singapur und der Golf von Thailand. Südostasien umfasst auch über 25.000 Inseln im malaysischen Archipel. Der Archipel besteht aus mehreren kleineren Inselketten. Zu diesen kleineren Inselgruppen gehören Indonesien, die Philippinen, die Maluku-Inseln und Neuguinea und die umliegenden Inseln.