Die Farben der Zwölf Stämme Israels sind rot; Grün; ein gestreiftes Rot, Weiß und Schwarz; Himmelblau; Dunkelblau; klar; Blau; Violett; grau; Aquamarin, Schwarz und schließlich eine Mischung aus allen Farben. Die Farben stammen von Edelsteinen, von denen in Exodus und dem Midrasch gesprochen wird, was besagt, dass jeder Stein des Brustpanzers der Zwölf Stämme zum Hintergrund der Flagge passte.
Entsprechende Edelsteine, von denen in Exodus 28:17-21 gesprochen wird, sind Rubin, Jade, Achat, Karbunkel, Lapislazuli, Quarzkristall, Türkis, Amethyst, Aquamarin, Onyx und Opal, der viele Farben enthält. Gemäß Exodus 28:21 repräsentierten Siegelringe, die mit den Steinen besetzt waren, jeden der Zwölf Stämme.
Zwölf Söhne Jakobs wurden die Anführer der Zwölf Stämme. Ruben, Levi, Simeon, Issachar, Juda und Sebulun waren Söhne von Jakobs Frau Lea. Benjamin und Joseph waren Söhne von Jakobs Frau Rahel. Naphtali und Dan waren Söhne von Rachels Magd Bilhah, und Asher und Gad waren Söhne von Leas Magd Zilpah.
Das neuassyrische Reich deportierte 10 der Stämme, als es Israel um 722 v. Chr. eroberte. Gruppen, die eine Abstammung beanspruchen, sind Bene Israel, Bnei Menashe, Beta Israel von Äthiopien, Igbo-Juden und die Paschtunen. Andere Theorien behaupten, dass die Kimmerier oder Skythen, die amerikanischen Ureinwohner, die Japaner und die Lemba in Südafrika Mitglieder der verlorenen Stämme waren.