Ein Pflanzenembryo ist eine junge und sich entwickelnde Pflanze. Ein Beispiel hierfür ist eine rudimentäre Pflanze im Samen einer höheren Pflanze oder im Archegonium in einem Moos oder Farn.
Die Pflanzenembryologie oder die Entwicklung einer ausgewachsenen Pflanze aus einem Embryo enthält einige Entwicklungselemente, die bei verschiedenen Tierarten beobachtet werden. Es gibt ein Ei und ein Spermium, die sich vereinigen, um die junge Zygote zu bilden. Das Samen tragende Organ der Pflanze wird als Stempel bezeichnet. Dort befindet sich das Ei. Sperma erreicht das Ei, indem es durch eine Röhre wandert.