Allegiant Air-Tickets sind nicht erstattungsfähig. Für Tickets, die innerhalb von sieben Tagen vor Reiseantritt storniert werden, oder für Tickets, bei denen Passagiere eine Trip Flex-Versicherung abgeschlossen haben, wird eine Gutschrift gewährt. Tickets ohne Trip Flex, die innerhalb des Stornierungsfensters storniert werden, werden mit Allegiant Air-Guthaben abzüglich Buchungsgebühren, Stornierungsgebühren und Fluggesellschaftsgebühren erstattet. Tickets mit Trip Flex werden in Form eines Allegiant Air-Guthabens abzüglich Fluggesellschaftsgebühren und Buchungsgebühren erstattet. Bei Erstattungen von Trip Flex werden keine Stornierungsgebühren erhoben.
Flugreisen, die 24 Stunden nach der Buchung und mindestens sieben Tage vor Abflug storniert werden, können gegen eine vollständige Rückerstattung storniert werden. Bei Änderungen der Tarifunterschiede nach der Reservierung oder bei Nichterscheinen von Kunden werden keine Rückerstattungen gewährt. Als Allegiant Air-Guthaben gewährte Rückerstattungen sind ungültig, wenn die Reise nicht innerhalb von 365 Tagen nach dem ursprünglichen Buchungsdatum abgeschlossen wird. Die Stornierungsgebühr, die von jedem Erstattungsguthaben abgezogen wird, beträgt 75 USD pro Strecke für Flugtickets ohne Trip Flex und muss sieben Tage im Voraus bezahlt werden.
Bei Trip Flex fallen keine Stornierungs- und Änderungsgebühren an und eine Ticketstornierung ist bis zu einer Stunde vor Abflug zulässig. Trip Flex-Gebühren und Reiseschutz können innerhalb der ersten 24 Stunden nach der Buchung storniert werden. Stornierungen, die über den Allegiant Air-Kundendienst vorgenommen werden, erhalten eine Rückerstattung, während Online-Stornierungen eine Gutschrift der Fluggesellschaft erhalten.