Die Funktion des Ladens von Farbstoff bei der Elektrophorese besteht darin, die DNA-Probe in die Vertiefungen des Gels zu versenken und den Wissenschaftlern zu ermöglichen, die DNA-Probe beim Durchlaufen des Gels visuell zu verfolgen. Gelelektrophorese ist eine Methode, die von Wissenschaftlern verwendet wird, um DNA in Stränge unterschiedlicher Größe aufzutrennen. Der Ladefarbstoff bewirkt, dass die DNA-Probe dichter ist als der Laufpuffer.
Der Dichteunterschied zwingt die DNA-Probe dazu, in den Boden der Vertiefung zu sinken und verhindert, dass die Probe in den Puffer diffundiert. Ladefarbstoffe bestehen aus Tracking-Farbstoffen, die mit den DNA-Proben wandern. Glycerin und Bromphenolblau ist eine übliche Mischung, die verwendet wird, um einen Ladepuffer herzustellen. Das Glycerin bindet an die DNA und macht sie schwerer, während Bromphenolblau die DNA färbt. Bei der Durchführung einer Gelelektrophorese wird im Allgemeinen eine Ethidiumbromidlösung verwendet. Ethidiumbromid ist eine Chemikalie, die unter ultravioletter Beleuchtung sichtbar ist. Ethidiumbromid und andere Fluoreszenzfarbstoffe binden an DNA-Proben und leuchten, wenn sie in einen Transilluminator gegeben werden. Die verwendete Farbstoffmenge ist entscheidend, wenn eine Gelelektrophorese durchgeführt wird. Bestimmte Farbstoffe korrelieren mit bestimmten Bandengrößen in DNA-Proben. Zu viel oder zu wenig Farbstoff kann die erwartete DNA-Probengröße verschleiern.