Während einige Christen die Farben des Regenbogens verwendet haben, um die Bedeutung der biblischen Geschichten zu interpretieren oder an sich zu reißen, weist die Bibel selbst den Farben keine Bedeutung zu. Der Regenbogen kommt in der Bibel nur zweimal vor, in das erste und letzte Buch. Christen empfinden ihren ersten Auftritt in der Flutgeschichte als etwas Besonderes, denn die biblische Flutgeschichte ist die einzige, die einen Regenbogen zeigt. Gott setzt einen Regenbogen in den Himmel als Symbol dafür, dass der Regen aufgehört hat und dass eine Flut solchen Ausmaßes nie wieder kommen wird.
Christliche Theorien über die weitere Bedeutung des Regenbogens und seiner Farben konzentrieren sich hauptsächlich auf Versuche, eine Korrelation zwischen den sieben Farben des Regenbogens und den sieben Tagen der Schöpfung darzustellen. Der Regenbogen wurde auch verwendet, um Parallelen zum Licht als Gottes erster Schöpfung und allen Farben der Erde als Reflexionen in verschiedenen Kombinationen der im Regenbogen dargestellten Farben zu ziehen. Weiter abgestuft ergibt sich der Punkt, dass Gott dem Menschen Licht gab, um uns zu zeigen, dass er alle Dinge umfasst. Aus dem gleichen Grund wird der Regenbogen manchmal als Symbol für Jesus verwendet, durch den Christen glauben, dass alles möglich ist.
In der Bibel steht die Farbe Rot typischerweise für Sünde und das Blut Christi, das Erlösung anbietet. Die Bibel spricht auch in den Büchern Exodus und Jesaja von Rot als Farbe des Leidens. Im Gegensatz dazu steht die Farbe Orange für das Urteil über menschliche Handlungen, wie biblische Autoren sowohl in den Psalmen als auch in der Offenbarung diskutieren. Keramik in der Bibel ist oft orange, und biblische Charaktere zertrümmern gelegentlich Keramik, um ihren Ekel vor menschlichem Verhalten auszudrücken.
Die Farbe Gelb steht für ewiges Leben und Ruhm. An vielen Stellen in der Bibel bedeutet ein gelbes Leuchten Frömmigkeit und spirituellen Status. Außerdem steht im Buch Hiob die Farbe Gelb für Bitterkeit.
Lila in der Bibel steht für Königtum. Könige in der Bibel kleideten sich oft in der Farbe. Darüber hinaus verwendeten Hohepriester der Bibel die Farbe Purpur für das Tor der Stiftshütte. In der Bibel steht Lila oft für Gottes Gerechtigkeit und Seinen Plan, Gerechtigkeit über die Welt zu bringen.
Gott zeigt am Ende der Flut, die die Welt zerstört hat, die Farben des Regenbogens. Die kombinierten Farben stehen nach dem Buch Hesekiel für die Macht Gottes. Wenn Gott Noah nach der Sintflut den Regenbogen zeigt, ist dies Sein Zeichen, dass es Gottes Plan ist, die Welt nie wieder mit einer Sintflut zu zerstören.