Flagellen helfen Zellkörpern wie Spermien und Bakterien, sich durch Flüssigkeit zu bewegen. Flagellen bestehen wie Zilien aus Mikrotubuli, die mit der Plasmamembran verbunden sind.
Die Mikrotubuli in einem Flagellum sind in neun Paare gruppiert, die ein Paar Mikrotubuli umgeben. Die Bewegung der Geißeln ist das Ergebnis des Aneinandergleitens der Mikrotubuli. Das Filament, das sich am Ende des Flagellums befindet, ist am Haken befestigt und besteht aus Flagellin. Die Bewegung des Filaments hängt von der Bewegung des Motors ab, der mit dem Haken verbunden ist. Der Basalkörper oder Motor, der von Zentriolen erzeugt wird, kann sich bis zu 300 Umdrehungen pro Sekunde bewegen.
In Bakterien ermöglicht das Flagellum dem Bakterienkörper, sich in einer geraden Linie nach oben oder unten zu bewegen und die Richtung zu ändern. Der Basalkörper, der sich an den Zellkörper anheftet, beeinflusst die Anordnung der Struktur des Filaments. Das Filament ist schraubenförmig, aber die Flagellinproteine ordnen sich neu an, wenn ein Drehmoment vom Motor aufgebracht oder entfernt wird. Einige Zellkörper mit Flagellen können sich durch Gewebe bewegen, was zu Problemen für das Lymph- oder Kreislaufsystem führt. Geißeln kommen oft einzeln oder in geringer Zahl vor, während viele Flimmerhärchen zusammen vorkommen.
