Ein Molekül ist eine Gruppe von zwei oder mehr miteinander verbundenen Atomen, während eine Verbindung eine Gruppe von zwei oder mehr miteinander verbundenen Atomen ist, bei denen die Atome aus mindestens zwei Arten von Elementen stammen. Alle Verbindungen sind auch Moleküle, aber alle Moleküle sind keine Verbindungen.
Die Formel H2O ist beispielsweise sowohl ein Molekül als auch eine Verbindung, aber H2 ist nur ein Molekül, da es nur Wasserstoffatome enthält. In der anorganischen Chemie ist der Begriff Molekül typischerweise auf Verbindungen mit neutraler Ladung beschränkt, während sich der Begriff Ion auf gebundene Atome mit entweder positiver oder negativer Ladung bezieht.