Der Unterschied zwischen einem Chihuahua mit Birnenkopf und einem Chihuahua mit Apfelkopf ist die Form des Schädels. Ein Chihuahua mit Apfelkopf hat einen runden, gewölbten Schädel, der einem Apfel ähnelt. Die birnenköpfige oder Hirschform ist oben flacher mit einer längeren Schnauze und ähnelt eher einer Birne als einem Apfel.
Nach dem offiziellen Standard des American Chihuahua Breed Club ist das richtige Aussehen eines Chihuahua immer der "Apfelkopf". Der Kopf des Hundes sollte eine gewölbte runde Form haben. Genetiker glauben, dass die Apfelform das Ergebnis einer Kombination von Mutationen ist, die Brachyzephalus und Hydrozephalus verursachen. Brachyzephalie ist eine Fehlbildung des Schädels, die dazu führt, dass er vorne "gequetscht" wird, was zu einer verkürzten Schnauze führt. Hydrozephalus ist eine übermäßige Menge an Flüssigkeit um das Gehirn herum, die ernsthafte Gesundheitsprobleme verursachen kann. Die Hirschform scheint etwas brachyzephal zu sein, aber es fehlt die Hydrozephalus-bezogene Kuppel. Birnenköpfige Hunde haben weniger gesundheitliche Probleme und sind möglicherweise leichter zu trainieren, möglicherweise weil sie keinen Hydrozephalus haben.
Laut dem American Chihuahua Breed Club leiden viele Chihuahuas an gesundheitlichen Problemen im Zusammenhang mit Hydrozephalus. Symptome des obstruktiven Hydrozephalus sind Schläfrigkeit, Aggression, Schwierigkeiten beim Stubenreinheit, veränderter Gang und in extremen Fällen Krampfanfälle. Wenn der Chihuahua jedoch einen nicht-obstruktiven Hydrozephalus hat, gibt es möglicherweise keine offensichtlichen klinischen Anzeichen.
