Der Stamm Zoomastigina enthält Organismen wie Trichonympha und Trypanosom, die Flagellum haben und zur größeren Klasse von Protozoen gehören. Dieser Stamm umfasst viele verschiedene Organismen, aber alle haben die Besonderheit, Flagellum zu haben , die lange, peitschenartige Verlängerungen in ihren Hinterteilen sind, die wie Schwänze aussehen und funktionieren. Organismen in diesem Stamm sind Eukaryoten; ihnen fehlen Chloroplasten und sie können in vielen verschiedenen Umgebungen leben, einschließlich der Erdoberfläche, unter der Erde, in der Atmosphäre und im Wasser.
Flagellaten und Trypanosomen gehören zu den häufigsten Organismen im Stamm Zoomastigina. Flagellaten sind einzellige und eukaryotische Organismen. Wie bei anderen Arten im Stamm haben Flagellaten Flagellen, aber diese Erweiterungen entwickeln sich, wenn Flagellaten das Erwachsenenalter erreichen. Flagellaten gehören zu den ältesten und am häufigsten vorkommenden Organismen auf der Erde; sie sind primitiv in ihrer biologischen Zusammensetzung und äußeren Erscheinung. Sie sind reichlich vorhanden und leben in vielen Gebieten, einschließlich des Verdauungstrakts anderer Organismen, einschließlich Säugetieren und sogar des Menschen. Flagellaten sind heterotroph und können sich sexuell oder asexuell vermehren. Trypanosomen ähneln im Aussehen Flagellaten, leben aber fast ausschließlich im Verdauungssystem von Mäusen und Ratten. Diese Organismen gehören zu den kleinsten Zoomastigina-Arten und sind im Allgemeinen gutartig, im Gegensatz zu Flagellaten und anderen Zoomastiginas, die Krankheiten und Infektionen übertragen und produzieren können.