Extraembryonales Mesoderm ist jedes Mesoderm in der Gebärmutter, das nicht Teil des Embryos selbst ist. Dazu gehören Mesoderm im Amnion, Chorion, Dottersack und dem Verbindungsstiel. Mesoderm befindet sich in der Mitte von drei primären Keimblättern des Embryos. Das embryonale Mesoderm bildet sich aus dem Hypoblast (der Beitrag des Trophoblasten ist wahrscheinlich), während dieses bei Mäusen aus dem kaudalen Ende des Primitivstreifens entsteht.
Die Implantation der Blastozyste in das Endometrium der Gebärmutter wird in der zweiten Woche der Entwicklung abgeschlossen. Embryoblasten (die Zellen der Masse) differenzieren in zwei Schichten; dies sind Hypoblast- und Epiblastschichten. Die Hypoblastenschicht besteht aus winzigen quaderförmigen Zellen, während die Epiblastenschicht aus hochsäulenförmigen Zellen besteht. Die Differenzierung der beiden in den Embryo bildet eine embryonale Scheibe.
Exocoelomische Membran und Hypoblast bilden die Auskleidung der exocoelomischen Höhle (primitiver Dottersack). Das extraembryonale Mesoderm wird aus den Zellen des Dottersacks gebildet und nimmt den Raum zwischen dem Trophoblasten von außen und der exocoelomischen Membran und dem Amnion von innen ein. Eine große Skala von Ereignissen innerhalb des extraembryonalen Mesoderms unterscheidet das extraembryonale Mesoderm in zwei Schichten: das extraembryonale somatische Mesoderm und das extraembryonale splanchnische Mesoderm. Der extraembryonale Anteil des Ektoderms und das extraembryonale somatische Mesoderm bilden das Amnion.