Seeigel werden von Vögeln, Seesternen, Kabeljau, Hummern und Füchsen gefressen. Lila Seeigel werden auch von Ottern im Nordwesten gefressen. Seeigel-Eier, auch Rogen genannt, werden von den Menschen in Asien als Delikatesse gegessen.
Die meisten Seeigel sind mit langen, spitzen Stacheln ausgestattet, die ihnen helfen, Raubtiere abzuschrecken. Seeigel, die in Südflorida vorkommen, haben scharfe giftige Stacheln, die in die Haut eindringen und abbrechen. Diejenigen, die in kühlen nördlichen Gewässern vorkommen, wie lila oder grüne Seeigel, sind normalerweise frei von Stacheln.
Unter den Stacheln eines Seeigels befindet sich ein harter äußerer Körper, der als Test bezeichnet wird. Es ähnelt dem harten Außenskelett anderer Meeresbewohner, die ebenfalls zum Stamm der Echinodermata gehören, wie Seesterne, Sanddollars, Seelilien und Seegurken. Die äußere Hülle besteht aus 10 verschmolzenen Platten, die den gesamten Körper in der gleichen Struktur wie die Scheiben einer Orange umgeben.
Jeder andere Abschnitt des Außenkörpers enthält Löcher, mit denen Seeigel ihre Röhrenfüße mithilfe eines Wassergefäßsystems verlängern können, wenn sie gehen oder sich beim Fressen an Gegenständen hängen müssen. Seeigel können auch mit ihren Stacheln oder Zähnen laufen.