Verschiedene Affenarten sind aus verschiedenen Gründen gefährdet, aber eine der Hauptursachen für die Gefährdung von Affen ist die Zerstörung von Lebensräumen, einschließlich der Waldzersplitterung. Ein weiterer häufiger Grund für die Gefährdung von Affen ist die Jagd.
Eine vom Aussterben bedrohte Affenart ist der schwarze Klammeraffe, der in Lateinamerika beheimatet ist. Sie sind Mitglieder des tropischen Regenwald-Ökosystems. Diese Affen leben in alten Wäldern, die leicht durch Waldfragmentierungspraktiken verletzt werden, bei denen ältere Bäume in zufälligen Bereichen des Waldes gefällt werden.
Ein weiterer gefährdeter Affe ist der Nasenaffe von der Insel Borneo. Sie sind durch die Zerstörung von Lebensräumen gefährdet. Die Menschen auf der Insel gehen häufig in die Wälder, um Häuser zu bauen und Bäume zu fällen.