Der Mensch kann einzelne Mikroorganismen wie Bakterien, Protozoen und bestimmte Pilze und Algen nicht sehen, riechen oder schmecken. Solche lebenden Organismen sind mikroskopisch klein und zu klein, um ohne Vergrößerungsinstrumente gesehen zu werden (sie waren erstmals 1675 von Anton van Leeuwenhoek beobachtet).
Einige Mikroorganismen vermehren, replizieren und schwärmen, um Cluster zu bilden, die groß genug sind, um von Menschen gesehen, gerochen und geschmeckt zu werden. Zum Beispiel können Bündel von Schimmelpilzsporen - Mitglieder des Pilzreichs - auf einem Brotlaib gesehen, gerochen und geschmeckt werden, während eine einzelne Schimmelpilzspore nicht nachweisbar ist.
Ein weiteres Beispiel sind Bakterien, die Mundgeruch verursachen. Obwohl sie mit bloßem Auge nicht sichtbar sind, haben Ansammlungen der Bakterien einen einzigartigen Geschmack und Geruch.