Drei Faktoren, die Enzyme denaturieren können, sind Temperatur, pH-Wert und Salzkonzentration. Enzyme sind Proteine; wie bei allen Proteinen arbeiten Enzyme nur in bestimmten optimalen Umgebungen. Diese optimalen Umgebungen umfassen bestimmte Temperaturbereiche, bestimmte pH-Werte und bestimmte Salzkonzentrationen.
Wenn sich ein Enzym nicht in seiner optimalen Umgebung befindet, funktioniert es möglicherweise nicht gut oder gar nicht. Enzyme werden in nicht optimalen Umgebungen denaturiert oder entstellt. Denaturierte Enzyme verlieren ihre natürlichen dreidimensionalen gefalteten Formen.
Viele Enzyme funktionieren bei hohen Temperaturen nicht gut. Eine Temperaturerhöhung begünstigt im Allgemeinen die Enzymfunktion, aber bei Temperaturen über 40 Grad Celsius funktionieren viele tierische Enzyme nicht mehr. Eine Verschiebung des pH-Werts beeinflusst Wasserstoffbrückenbindungen, eine schwache Art von Bindung, die Teile des Enzyms miteinander verbindet; dies verändert die Form des Enzyms. Änderungen des Salzgehalts beeinflussen die R-Gruppenbindung in Aminosäuren, den Bausteinen aller Proteine. Diese R-Gruppen, auch Aminosäureseitenketten genannt, interagieren miteinander, um die dreidimensionale Form eines Proteins zu erzeugen.