Der Jaguar hat laut Rainforest Alliance keine natürlichen Feinde. Der Mensch ist die Hauptbedrohung für Jaguare durch Wilderei und den Verlust des natürlichen Lebensraums.
Jaguare leben in vielen verschiedenen Lebensräumen, obwohl sie am häufigsten in Dschungeln und Wäldern zu finden sind. Der Verlust der natürlichen Lebensräume hat zu einer Zunahme des Kontakts mit Menschen geführt, die Jaguare wegen ihres Fells töten, obwohl diese Praxis nicht mehr so üblich ist wie früher. Die Rainforest Alliance gibt an, dass es nur noch etwa 15.000 Jaguare in freier Wildbahn gibt. Jaguare jagen auch einige der gleichen Arten wie Menschen, was die Gefahr des menschlichen Kontakts erhöht.