Fledermäuse haben Augen. Flughunde haben sehr große Augen, die ihnen helfen, sich in tiefer Dunkelheit zurechtzufinden und ihr bevorzugtes Futter zu finden. Nur die als Microchiropterans bekannte Gruppe von Fledermäusen verlässt sich hauptsächlich auf die Echoortung, aber auch diese Fledermäuse haben Augen.
Obwohl Mikrochiroptera-Fledermäuse nicht so sehr auf das Sehen angewiesen sind wie andere Tiere, sind ihre Augen immer noch vorhanden und funktionsfähig. Diese Fledermäuse nutzen ihre einzigartigen Echoortungsfähigkeiten, um die Welt um sie herum wahrzunehmen, nutzen aber dennoch das Sehvermögen, um ihnen zu helfen, wenn Echoortungshinweise verwirrend oder aufgrund von Hintergrundgeräuschen schwer zu erkennen sind. Flughunde hingegen nutzen Sehen und Riechen eher als Hören als ihre primären Sinne. Beide Fledermausgruppen haben eine sehr gute Nachtsicht, aber eine schlechte Sehschärfe, die bestenfalls der einer Ratte oder einem Hund ähnelt. Nur Flughunde scheinen ein Farbsehen zu haben, was durch das Vorhandensein spezieller Farbsensorzellen in ihrer Netzhaut angezeigt wird.