"Three Skeleton Key" handelt von drei Männern, die in einem Leuchtturm auf einer Insel namens Three Skeleton Key arbeiten. Es konzentriert sich auf einen Vorfall, bei dem ein Schiff voller Ratten auf der Insel abstürzt und die Männer kämpfen müssen, um am Leben zu bleiben.
Die drei Männer, die am Leuchtturm arbeiten, sind die namenlosen Erzähler Le Gleo und Itchoua. Sie entdecken das verlassene Schiff, als es sich nähert, und sehen dann die Ratten, wie es näher kommt. Diese Ratten sind groß und bösartig, und die Männer vermuten, dass die Ratten die Schiffsbesatzung getötet und gefressen haben.
Als das Schiff auf der Insel abstürzt, sichern die Männer den Leuchtturm, um die Ratten fernzuhalten. Sie verbringen viele Tage und Nächte in der Falle, und obwohl sie Vorräte haben, wird das nächste Versorgungsschiff erst in Wochen ankommen. Sie können nicht um Hilfe rufen, da sie nach draußen gehen müssen.
Das Siegel an einem Fenster erlischt eines Nachts und die Männer müssen die Rattenhorde bekämpfen. Sie schließen sich im Laternenraum ein. Ohne Nahrung oder Wasser verzichten sie auf das Anzünden der Laterne, was normalerweise nur geschieht, wenn alle im Leuchtturm tot sind.
Ihr Plan führt schließlich dazu, dass sie gerettet werden, nachdem die Küstenwache dabei hilft, die Ratten zu töten. Der Vorfall treibt Le Gleo jedoch in den Wahnsinn und Itchoua stirbt an einer Infektion. Der Erzähler beschließt, weiter am Leuchtturm zu arbeiten.
