Das endokrine System beeinflusst das Ausscheidungssystem hauptsächlich durch die Kontrolle der Wassermenge, die mit dem Urin freigesetzt wird. Das endokrine System setzt eine Reihe von Hormonen frei, damit die Nieren Wasser aus dem Urin resorbieren, wenn Blutwasserspiegel sind niedrig.
Der Hypothalamus überwacht den Elektrolytspiegel im Blut. Eine steigende Elektrolytkonzentration weist auf Dehydration hin, während eine niedrigere Konzentration auf eine Überhydratation hinweisen kann. Die häufigsten Ursachen für Dehydration sind unzureichende Wasseraufnahme, übermäßiges Schwitzen und Blutverlust. Wenn der Hypothalamus erkennt, dass der Körper dehydriert ist, produziert er ein antidiuretisches Hormon, das dann in die Hypophyse übertragen und von dieser freigesetzt wird.
Antidiuretisches Hormon zirkuliert zu den Nieren, wo es die Wasserresorptionsrate erhöht. Es tut dies, indem es die Nieren veranlasst, Wasserkanäle in den Tubuli zu bilden, die sich durch die Nieren winden. Das in den Blutkreislauf zurückfließende Wasser bewirkt eine Reduzierung des antidiuretischen Hormons, bis die Kanäle wieder geschlossen sind.
Ein weiteres Hormon, das die Wasseraufnahme der Nieren reguliert, ist Aldosteron, das von den Nebennieren produziert wird. Aldosteron verändert die Art und Weise, wie der Körper mit gelösten Chemikalien umgeht, um die Wasseraufnahme durch die Nieren zu beeinflussen.