Hurrikane können bewaldete Ökosysteme verwüsten und alle Blätter aus den Baumkronen entfernen. Außerdem können sie Lebensräume so drastisch verändern, dass die einheimischen Tierpopulationen darunter leiden. Vom Aussterben bedrohte Arten in tropischen, Mündungs- und Küstenlebensräumen sind bei Hurrikanen besonders gefährdet.
Die Winde von Hurrikanen haben die sichtbarsten Auswirkungen auf die Umwelt. Wenn man nach einem Hurrikan über einen Regenwald fliegt, zeigt sich oft, dass die Baumkronenschicht vollständig verschwunden ist, was sich auf das Leben von Vögeln und Tieren auswirkt, die früher das Gebiet direkt darunter als Lebensraum genutzt hatten. Bewaldete Gebiete wie Sümpfe und Sümpfe werden erheblich zerstört, wenn Winde Bäume entwurzeln und zerstören.
Sturmfluten und beträchtliche Regenfälle in Kombination mit den starken Winden bedrohen die Nahrungsversorgung der verbleibenden Tiere, die nicht vom Sturm getötet wurden. Als der Hurrikan Hugo 1989 Puerto Rico traf, starb die Hälfte der verbliebenen puertoricanischen Papageien der Welt im Sturm. Der Cozumel Thrasher, der nur auf der mexikanischen Insel Cozumel lebt, ist nach dem Hurrikan Gilbert 1988 fast ausgestorben.
Hurrikane verändern auch die Form von Küstenlandschaften, indem sie riesige Mengen Sand verlagern. Hurrikane in den Jahren 2004, 2005 und 2008 verursachten große Verschiebungen an der Küste des Golfs von Mexiko; Zwischen den Hurrikanen Katrina und Rita, die beide 2005 trafen, gingen etwa 73 Quadratmeilen Land dem Meer verloren.