Der Wert eines Nintendo 64-Systems liegt zwischen 28 und 999,99 US-Dollar (Stand 2014). Der Preis variiert je nach Systemmodell, Farbe und Zustand. Nintendo 64-Systeme sind wertvoller, wenn sie sich noch in der Originalverpackung befinden.
Das Modell mit dem niedrigsten Wert ist das Nintendo 64 Standardsystem im gebrauchten Zustand. Das wertvollste Modell ist das Atomic Black Nintendo 64-System in seiner Originalverpackung. Sobald ein Nintendo 64 einmal geöffnet wurde, sinkt sein Wert dramatisch. Das Atomic Black Nintendo 64-System wird im gebrauchten Zustand mit 59,39 US-Dollar und im Neuzustand mit 999,99 US-Dollar bewertet. Nintendo 64-Systeme werden online und in elektronischen Wiederverkaufsgeschäften im ganzen Land verkauft.