Kaiserfische reproduzieren sich sexuell: Ein Männchen und ein Weibchen halten sich in kurzen Zeiträumen der Balz, die letztendlich zur Befruchtung der Eier führen.Kaiserfisch-Männchen sind ziemlich territorial und verteidigen ihre Territorien pflichtbewusst und verlassen sie nur, um sich zu paaren Weibchen während der Frühjahrsbrutzeit.
Zu Beginn der Balz wechseln männliche und weibliche Kaiserfische ihre Farbe. Weibchen nehmen mildere Farbtöne an und werden bräunlich oder hellbraun, während die Mundbereiche der Männchen weiß werden; ihre umgebenden Gesichtsmasken werden dunkelblau. Kaiserfische paaren sich in der Abenddämmerung und schwimmen dazu schnell an die Oberfläche. Die Eier, die nach der Paarung sofort befruchtet werden, werden dann in Strömungen freigesetzt, um ins offene Meer getragen zu werden, wo sie idealerweise schlüpfen und überleben.
