Ein Elektronenmikroskop hat eine höhere Auflösung als ein Lichtmikroskop, was zu viel feineren Details der betrachteten Probe führt. Obwohl ein Elektronenmikroskop eine Probe bis zu 2 Millionen Mal vergrößern kann, ist ein Licht Mikroskop ist bei der Betrachtung lebender Zellen von Vorteil.
Elektronenmikroskopie verwendet einen Elektronenstrahl anstelle von Licht, um eine Vergrößerung zu erzielen. Dazu passieren Elektronen ein dünnes Stück der Probe. Die Wellenlängen eines Elektronenstrahls sind viel kleiner als die von Licht, was eine bessere Auflösung ermöglicht. Aufgrund seiner Fähigkeit, solch ein hohes Auflösungsniveau zu erreichen, ist es möglich, die Form einer Probe zu sehen. Obwohl die endlichen Details in vielen Fällen von Vorteil sind, muss die unter einem Elektronenmikroskop betrachtete Probe während der Präparation fixiert werden, damit die Struktur nicht gestört wird, was bedeutet, dass die Probe nicht lebendig ist und nur ihre visuellen Eigenschaften beobachten kann.
Lichtmikroskopie funktioniert auf Basis der Beugung. Um eine Vergrößerung zu erreichen, geht Licht entweder durch eine Probe hindurch oder wird von ihr reflektiert, bevor es durch die optischen Linsen übertragen wird. Unter bestimmten Bedingungen können lebende Zellen und ihre biologischen Funktionen wie Nahrungsaufnahme und Zellteilung betrachtet werden. Zuschauer können auch Proteine verfolgen und Zellbewegungen beobachten.
