Eine lange Kette aus vielen Aminosäuren wird als Polypeptid bezeichnet. Ein Polypeptid hat Hunderte oder sogar Tausende von Aminosäuren, die miteinander verbunden sind, während ein Peptid eine kleinere Kette von Aminosäuren ist. Wie der Name schon sagt, bestehen Polypeptide aus mehreren Peptiden.
Eine lange Kette von Aminosäuren kann auch als Protein betrachtet werden oder nicht. Im Allgemeinen wird die basische Säurekette als Polypeptid betrachtet, bis sie ihre endgültige dreidimensionale Form annimmt, die funktionsfähig ist. Darüber hinaus bestehen bestimmte Proteine sowohl aus Polypeptiden als auch aus anderen molekularen Gruppen, die als Cofaktoren oder prothetische Gruppen bezeichnet werden. Proteine sind in den meisten lebenden Organismen für eine Vielzahl biologischer Aufgaben verantwortlich.