Pilze nehmen Nährstoffe über Strukturen auf, die Hyphen genannt werden, so das Museum für Paläontologie der University of California. Im Gegensatz zu Pflanzen können Pilze ihre Nahrung nicht selbst herstellen, daher sind sie für ihre Ernährung auf andere Organismen angewiesen. Pilze sind oft Saprophyten, die totes organisches Material aufnehmen; einige fungieren auch als Parasiten oder mutualistische Symbionten.
Hyphen sehen aus wie eine farblose Masse von Fäden, die zusammen das Myzel bilden. Die Spitze der Hyphen sondert Verdauungsenzyme ab, die im Boden vorhandene Nahrungsprodukte abbauen können. Hyphen verlängern sich beim Wachsen an ihren Spitzen und können im richtigen Medium schnell wachsen. Das Myzel ist ideal für die Nahrungsaufnahme, da die Hyphen im Vergleich zu ihrer Größe eine große Oberfläche besitzen. Einige Pilze haben zwischen den Hyphen Löcher, die Septen genannt werden, die es ihnen ermöglichen, sich miteinander zu verbinden und Substanzen weiterzugeben. Die Hyphen bauen Nahrung außerhalb der Pilze ab, bevor sie die Nährstoffe aufnehmen. Pilze nehmen ihre Nahrung nicht auf; sie leben in ihrer Nahrung und nehmen nur die Nährstoffe auf, die bereits verdaut wurden.
Parasitäre Pilze, die Pflanzen fressen, haben spezialisierte Hyphen namens Haustorien, die die Zellwand einer Pflanze durchdringen und auf diese Weise Nahrung von der Pflanze beschaffen können. Bei symbiotischen Assoziationen wie Mykorrhizen, bei denen Pilze eine Beziehung zu den Wurzeln bestimmter Pflanzen eingehen, nehmen die Pilzhyphen Mineralien und Wasser aus dem Boden auf.
