Abgesehen davon, dass sie von Menschen wegen ihres Fells gejagt werden, sind die Wölfe das größte Raubtier der Kojoten. Tatsächlich haben Wölfe seit ihrer Wiederansiedlung im Yellowstone-Nationalpark im Jahr 1995 die Kojotenpopulation um 39 % reduziert , laut Studien.
Obwohl Wölfe manchmal Kojoten fressen, haben die beiden keine vollständige Räuber-Beute-Beziehung. Stattdessen stehen sowohl Kojoten als auch Wölfe an der Spitze ihrer Nahrungskette und stehen in direkter Konkurrenz um Beute, selbst an den tatsächlichen Tötungsorten. Da Wölfe in ihrem Rudelverhalten kooperieren, während Kojoten alleine leben und jagen, ist der Kojote bei Konfrontation deutlich im Nachteil.