Alabama hat eine große Anzahl einheimischer Arten, darunter Wildschweine, Weißwedelhirsche, Rotluchse, Rot- und Graufüchse, Kojoten, nordamerikanische Flussotter, Stinktiere, Waschbären, Opossums und Gürteltiere. Alabama ist auch die Heimat einer vielfältigen Population von Vögeln, Insekten und Reptilien.
Einige Arten, die einst in Alabama gefunden wurden, wurden aus dem Bundesstaat vertrieben, wie Elch, Bison, Rotwolf und Puma. Einige andere Arten, wie der Schwarzbär, sind dort ab 2014 noch vorhanden, aber in geringer Zahl. Es gab auch unbestätigte Sichtungen des Jaguarundi, einer kleinen otterähnlichen Katze. Im Sommer ist die vom Aussterben bedrohte Seekuh in Küstengewässern zu finden. Der Carolina-Sittich wurde in ganz Alabama gefunden, wurde aber durch den Verlust seines Lebensraums ausgerottet.
Alabama ist auch für seine Hochseefischerei bekannt, insbesondere für Welse und Krebse. Einhundertachtundfünfzig verschiedene Vogelarten brüten in Alabama regelmäßig, während 174 weitere Arten dort überwintern. Dazu gehören wilde Truthähne, Greifvögel wie Turmfalken und Falken, Küstenvögel, Spechte und Seetaucher. Der Staat hat auch 62 Säugetierarten und 93 Reptilienarten, darunter den amerikanischen Alligator in den südlichen Teilen des Staates. Es wird angenommen, dass die östliche Indigoschlange aus Alabama ausgerottet wurde, aber ab 2010 wieder eingeführt wurde.
