Eingeschränkter Zugang zu hochwertiger Technologie, schlechte Computerkenntnisse, soziale Isolation und die Notwendigkeit von Selbstdisziplin sind Nachteile oder potenzielle Probleme mit virtuellen Lernumgebungen. Da Online-Kurse von Computertechnologie und Internet angetrieben werden Zugang hat eine Person ohne diese Fähigkeiten eine Herausforderung für effektives Lernen.
Obwohl die flexible Planung ein wesentlicher Vorteil des Online-Lernens ist, sind die Unfähigkeit, die Leistung selbst zu planen und zu regulieren, für einige Nachteile. Schüler, denen es an Motivation und Selbstdisziplin mangelt, haben in einer virtuellen Lernumgebung normalerweise mehr Probleme als in einem traditionellen Klassenzimmer. Es gibt keine Lehrkräfte und Peers, die regelmäßig an Aufgaben, Projekte und Tests erinnern können. Die Schüler müssen ihr Tempo selbst bestimmen und genügend Zeit einplanen, um Unterrichtsaktivitäten und Aufgaben außerhalb des Unterrichts zu erledigen.
Eingeschränkte Interaktion mit dem Lehrer und die Isolation von einer Lerngruppe sind ebenfalls Nachteile. In der Regel versuchen Kursleiter, per E-Mail oder über das virtuelle Lerntool zu kommunizieren. Schwieriger ist es jedoch, aus der Ferne richtiges Zuhören und Verstehen sicherzustellen. Außerdem dauert die Interaktion und das Feedback durch virtuelle Tools länger als bei einem traditionellen persönlichen Austausch. Soziale Isolation kann eine Herausforderung für Schüler sein, die von der täglichen Interaktion mit Gleichaltrigen und dem informellen Komfort eines traditionellen Klassenzimmers profitieren.