Laut Nature Education werden Restriktionsenzyme verwendet, um DNA in kleinere Stücke zu schneiden, die dann mittels Gelelektrophorese nach Größe getrennt werden können. Typische Restriktionsenzyme schneiden DNA an vier oder sechs Basenpaar-Erkennungsstellen, was zu sehr kleinen DNA-Stücken führt.
Laut einer Biotechnologie-Webseite des Bundesstaates Colorado werden Restriktionsenzyme von bakteriellen Enzymen abgeleitet, die eine Form des rudimentären Immunsystems für Bakterien darstellen. Diese Enzyme haben sich entwickelt, um jede fremde DNA in den Bakterien zu zerschneiden und zu zerstören, weshalb sie die DNA in kleine Stücke schneiden. Restriktionsenzyme und Gelelektrophorese werden auch für die DNA-Rekombinationstechnologie verwendet, die es ermöglicht, gentechnisch veränderte Gene für Klonierungszwecke in die DNA ein- und auszulagern.
