Zellatmung und Fermentation sind zwei Wege, die der Glykolyse folgen. Die Zellatmung erfordert Sauerstoff, während die Fermentation in Abwesenheit stattfindet. Die Zellatmung besteht aus einem chemischen Stoffwechselweg namens Krebs-Zyklus oder Zitronensäure-Zyklus, gefolgt von einem Elektronentransportsystem.
Eine Übergangsreaktion tritt nach der Glykolyse auf und bevor entweder die Atmung oder die Fermentation beginnt. Pyruvat, das Produkt der Glykolyse, wird zu Acetyl-CoA, einem energiereichen Molekül, verarbeitet. Krebs-Zyklus-Reaktionen verarbeiten das Acetyl-CoA zu elektronentragenden Molekülen ATP und NADH. Das Elektronentransportsystem leitet diese durch chemische Gradientenmembranen, um zusätzliches ATP zu erzeugen, das zum Antrieb zellulärer Prozesse verwendet wird. Durch Fermentation wird Acetyl-CoA in Ethanol oder Milchsäure umgewandelt.
