Southwest Airlines verwendet nicht das traditionelle "Hub-and-Spoke"-System, das von anderen Fluggesellschaften verwendet wird, sondern bietet stattdessen "Punkt-zu-Punkt"-Operationen an, bei denen Passagiere direkt zu ihren Zielen reisen. Southwest hat jedoch wichtige Niederlassungen in den folgenden Städten: Baltimore, Chicago, Denver, Houston, Las Vegas, Los Angeles, Oakland, Orlando und Phoenix.
Im Durchschnitt sind 80 % der Passagiere von Southwest lokale Passagiere, nur 20 % sind Anschlusspassagiere. In den genannten Schwerpunktstädten können die Anschlusspassagiere jedoch bis zu 30 Prozent erreichen. Diese Zahlen sind jedoch viel niedriger als bei den meisten anderen Fluggesellschaften. Vor 2014 flog Southwest nicht international, aber ab dem 1. Juli 2014 sind Flüge nach Aruba, Jamaika und auf die Bahamas verfügbar.