Die fünf Ebenen der ökologischen Organisation sind Spezies, Population, Gemeinschaft, Ökosystem und Biosphäre. Ökosysteme können auf kleiner lokaler Ebene oder auf Makroebene untersucht werden. Ebenso können Arten, Populationen und Gemeinschaften einzeln oder auch als größere Gruppen untersucht werden.
Der kleinste Zweig der Ökologie sind die Arten. Diese Gruppe umfasst Pflanzen, Tiere und andere lebende Organismen, die biologisch verwandt sind und oft eine gewisse physische Ähnlichkeit aufweisen. Zu den Arten gehören Tiere und Pflanzen, die auf der ganzen Welt leben und im Wasser und an Land überleben. Affen, Affen und Ameisen sind Beispiele für Arten, ebenso wie Algen, Farne und Seeigel. Auf dieser Ebene werden Individuen nicht als die gleiche Art betrachtet, wenn Mitglieder nicht ähnliche Nachkommen produzieren können, die sich wiederum vermehren können, um dieselbe Art zu schaffen. Arten werden anhand einer taxonomischen Struktur klassifiziert; sie werden wissenschaftlich durch zwei Namen identifiziert, und der Artname bildet das letztere Wort.
Die Bevölkerung ist die zweite Ebene der ökologischen Hierarchie. Diese Strukturen sind Gruppen von Organismen, die derselben Art angehören und mit anderen Artmitgliedern leben und mit ihnen interagieren. Gemeinschaften beziehen sich eher auf den Standort als auf den Organismustyp. Gemeinschaften umfassen Gruppen (Populationen) verschiedener Organismen, die an einem Ort leben. Wälder zum Beispiel enthalten eine Gemeinschaft aus Vögeln, Pflanzen, Bakterien und Bäumen.
Ökosysteme sind die nächsthöhere Klassifizierungsstufe. Ökosysteme umfassen alle lebenden Organismen in einem Gebiet und auch die nicht lebenden Faktoren dieser Orte. Schließlich sind Biosphären Teile des Planeten, die lebende Organismen enthalten. Der größte Teil der Welt gilt als Biosphäre, einschließlich der Ozeane und der Atmosphäre.