Elizabeth Proctor wurde von Mary Warren während der Hexenprozesse von Salem im Jahr 1692 beschuldigt, eine Hexe zu sein. Sie war zu dieser Zeit schwanger und wurde daher nicht zum festgesetzten Zeitpunkt hingerichtet. Als Elizabeths Baby geboren war, waren die Hexenprozesse beendet und sie wurde begnadigt.
Laut dem Salem Massachusetts City Guide wurde Elizabeth Proctor am 28. März 1692 als Hexe denunziert. Am 11. April wurden Elizabeth und Sarah Cloyce von mehreren Stadtbeamten, darunter dem stellvertretenden Gouverneur Thomas Danforth und Captain Samuel ., vor Gericht vernommen Sewall wurden beide Frauen der Hexerei beschuldigt und inhaftiert.
Elizabeth Proctor blieb bis Anfang August in Salem im Gefängnis, als sie wegen Hexerei vor Gericht gestellt und verurteilt wurde. Die anderen angeklagten Hexen, die an diesem Tag vor Gericht standen, darunter Elizabeths Ehemann John, wurden auf dem berüchtigten Gallows Hill gehängt, aber Elizabeth wurde ein vorläufiger Hinrichtungsaufschub zugesprochen, weil sie schwanger war.
Als Elizabeth Proctor geboren wurde, waren die Hexenprozesse von Salem vorbei. Elizabeth wurde begnadigt und aus dem Gefängnis entlassen. Aber laut Gesetz war sie immer noch eine verurteilte Schwerverbrecherin. Dies hinderte Elizabeth daran, das Eigentum ihres Mannes John Proctor zu beanspruchen. Dazu gehörte auch die Familientaverne, die sie viele Jahre lang betrieb. 1697, fünf Jahre nach den Hexenprozessen, stellte ein Nachlassgericht die Mitgift von Elizabeth Proctor wieder her.
Am 17. Dezember 1710 erhielt Elizabeth Proctor 578 Pfund und 12 Schilling als Entschädigung für den Tod ihres Mannes John.