Ein pathogener Organismus ist ein Bakterium, ein Pilz, ein Prion oder ein Virus, das überlebt, indem es sich von einem Wirt ernährt. Ein pathogener Organismus verursacht typischerweise eine Krankheit im Wirtsorganismus.
Obwohl die meisten Bakterien beim Menschen keine Krankheiten verursachen, sind Menschen mit einem geschwächten Immunsystem anfälliger für opportunistische Krankheitserreger, die oft in der warmen, feuchten Umgebung des menschlichen Körpers gedeihen. Zu den natürlichen Reaktionen des Körpers auf eindringende pathogene Organismen gehört ein Anstieg der Körpertemperatur. Viele dieser natürlichen Reaktionen hemmen die Lebens- und Fortpflanzungsfähigkeit dieser Organismen. Um zu überleben, wenn sie mit Antibiotika konfrontiert werden, haben sich einige Bakterienstämme entwickelt und die Fähigkeit entwickelt, den am häufigsten verschriebenen Medikamenten zu widerstehen, die verwendet werden, um den Körper von diesen Krankheitserregern zu befreien.