Die Ordnungszahl von Kohlenstoff ist 6 und seine Atommasse beträgt 12,0107 Atommasseneinheiten. Die Ordnungszahl definiert die Anzahl der Protonen, die sich im Atomkern befinden, also hat Kohlenstoff sechs Protonen. Jedes Element hat seine eigene Ordnungszahl.
Da sich die Masse des Atoms aus der Anzahl der Protonen und Neutronen zusammensetzt, hat Kohlenstoff auch sechs Neutronen in seinem Kern. Es hat sechs Elektronen, die den Kern umgeben, mit zwei im ersten Energieniveau und vier im zweiten Energieniveau. Elektronen tragen nicht so viel zur Masse eines Atoms bei wie Neutronen und Protonen.