Das Gilgamesch-Epos hat mehrere moralische Themen, aber das Hauptthema ist, dass die Liebe eine motivierende Kraft ist. Andere moralische Themen in diesem Epos sind die Unvermeidlichkeit des Todes und die Gefahr, mit den Göttern umzugehen .
Die Liebe in der Freundschaft zwischen Enkidu und Gilgamesh inspiriert beide dazu, auf unterschiedliche Weise bessere Männer zu werden. Gilgamesh war in der Lage, Enkidu aus seinen egozentrischen Wegen herauszuholen und Enkidu zum Adel zu inspirieren. Im Gegenzug überprüft Enkidu die Unruhe von Gilgamesh und motiviert Gilgamesh, sein Mobbing und seine Tyrannei zu stoppen, damit er ein besserer Held und König werden kann. Ihre Verbindung ermöglicht es Gilgamesch, mit den Bedürfnissen seines Volkes in Kontakt zu treten.
Das Fehlen eines romantischen weiblichen Interesses an diesem Epos bedeutet nicht, dass erotische Liebe keine Rolle spielt. Enkidus Ausbildung beginnt mit seiner sexuellen Initiation durch eine Tempelhure. Damit beginnen die Schwierigkeiten der beiden Helden, die mit ihrer Ablehnung von Ishtar, der Göttin der Liebe, zusammenfallen. Erst als Gilgamesh versteht, dass sein Platz auf der Erde ist, kehrt Ishtar zu ihrem Ehrenplatz zurück.
Eine weitere großartige Lektion, die Gilgamesh lernt, ist die unausweichliche Wahrheit des menschlichen Todes. Er ärgert sich über die Unsterblichkeit der Götter, und als Enkidu einen qualvollen Tod stirbt, bekommt Gilgamesch noch mehr Angst vor seinem eigenen Tod. Seine zweite Suche nach Utnapishtim, ein Versuch, dem Tod zu entkommen, lehrt ihn, dass die Menschheit trotz des Todes der Menschen weiterlebt.
Sowohl Gilgamesh als auch Enkidu erfahren, dass der Umgang mit den Göttern gefährlich ist, da sie sich emotional und irrational verhalten können. Durch die große Flut lernen sie, dass die Handlungen der Götter von den Menschen nicht verstanden werden können. In Mesopotamien sind Frömmigkeit und Respekt vor den Göttern keine Verpflichtung, sondern eher eine praktische Anerkennung der Macht der Natur und eine Erinnerung an die Rolle der Menschheit im Gesamtsystem der Dinge.