Agarplatten werden vor dem Animpfen und Inkubieren auf den Kopf gestellt, damit eventuell vorhandenes Kondenswasser auf dem Deckel nicht in das Nährmedium tropft. Der Deckel der Agarplatte wird nicht aufgesetzt auf einer Arbeitsplatte oder anderswo, und sein Inneres darf nicht berührt werden, damit keine Verunreinigungen aus der Luft die Kultur beeinträchtigen können. Beim Einlegen in den Brutschrank bleibt die Agarplatte kopfüber, so dass die Kultur weiterhin vor einer möglichen Kontamination geschützt ist.
Agarplatten sind Petrischalen, die ein für die Kultivierung von Mikroorganismen geeignetes Medium enthalten. Sie können auch als Blutagarplatten bezeichnet werden, wenn sie rote Blutkörperchen enthalten, oft von Pferden oder Schafen, die oft als Nährstoff verwendet werden. Da manche Bakterien nur bereits abgebaute rote Blutkörperchen verdauen können, enthalten manche Agarplatten ein vorgewärmtes Medium, das die Blutkörperchen abbaut und ihnen eine bräunliche Farbe verleiht. Dies wird aufgrund seiner Farbe oft als "Schokoladenagar" bezeichnet und spiegelt nicht die Anwesenheit von Schokolade als Wachstumsmedium wider.
Agarplatten können auch Antibiotika enthalten, die das Wachstum bestimmter Bakterienstämme verhindern. Dies dient dazu, die Platte selektiv für die Identifizierung spezifischer Bakterienarten zu machen, indem die Möglichkeit des Wachstums durch andere Stämme ausgeschlossen wird. Diese werden als "restriktive" oder "selektive" Platten bezeichnet. Diese Agarplatten, die das Wachstum von Organismen ermöglichen, mit denen sie beimpft werden, werden als "permissive" Platten bezeichnet.