Elektrophorese ist wichtig, da sie zur Trennung von Makromolekülen wie DNA, RNA und Proteinen verwendet wird. Gele, die aus Polyacrylamid hergestellt werden, werden typischerweise verwendet, um DNA und Proteine aufgrund ihrer unterschiedlichen Größen zu trennen. Proteine werden auch aufgrund ihrer unterschiedlichen Ladungen getrennt.
Bei der Elektrophorese, auch bekannt als Gelelektrophorese, um DNA-Moleküle zu trennen, wird eine Lösung der Moleküle in ein Gel gegeben. Die negativ geladenen DNA-Moleküle werden durch ein elektrisches Feld durch das Gel gezogen. Kleine DNA-Moleküle bewegen sich schneller durch das Gel als große DNA-Moleküle. Die Bewegung der Moleküle durch das Gel erzeugt eine Reihe von Banden. Jede Bande wird in DNA-Moleküle einer bestimmten Größe getrennt. Die am weitesten vom Gelanfang entfernten Banden enthalten die kleinsten DNA-Fragmente, während die am nächsten zum Gelanfang gelegenen die größten DNA-Fragmente enthalten.
Elektrophorese wird verwendet, um DNA-Fragmente zu trennen, um einen DNA-Fingerabdruck für forensische Zwecke, Vaterschaftstests, PCR-Reaktionen zu überprüfen und nach evolutionären Beziehungen zwischen Organismen zu suchen. Das Verfahren wird auch verwendet, um Gene zu testen und zu lokalisieren, die mit einer bestimmten Krankheit in Verbindung stehen, und um zwischen Proben von genetischem Material zu unterscheiden.