Protonen haben alle die gleiche Masse; die Masse jedes Protons beträgt 938,27 Megaelektronenvolt oder 1,6726231*10-27 Kilogramm. Tatsächlich sind alle Protonen identisch, ebenso wie alle Elektronen und alle Neutronen, obwohl jedes dieser drei subatomaren Teilchen unterscheidet sich von den anderen beiden Arten. Protonen und Neutronen haben fast die gleiche Masse, wobei Protonen nur geringfügig weniger wiegen als Neutronen (1.6749286*10-27 kg), aber Elektronen sind leichter als Protonen und Neutronen und wiegen 9.1093897*10< sup>-31 kg.
Protonen, Neutronen und Elektronen sind subatomare Teilchen, aus denen alle Atome bestehen. Atome sind die Bausteine von allem im Universum. Die Protonen und Neutronen bilden den Atomkern; Protonen und Neutronen liefern den Großteil des Gewichts eines Atoms, daher befindet sich der Großteil der Masse eines Atoms im Kern, während die dünne äußere Elektronenwolke vergleichsweise wenig Gewicht bereitstellt.
In einer anderen Masseneinheit hat ein Proton 1.007316 Atommasseneinheiten, während ein Neutron 1.008701 Atommasseneinheiten hat. Da Einstein bewiesen hat, dass Masse und Energie gleich sind (E = mc2), ist es für Wissenschaftler möglich, eine oder beide Energieeinheiten und Masseneinheiten zu verwenden, um die Masse eines Protons zu messen.
