Obwohl eine schriftliche Liste aller Yu-Gi-Oh! Karten aufgrund der großen Anzahl von Karten, die im Laufe der Jahre gedruckt wurden, schwer zu finden ist, bieten organisierte Online-Datenbanken einen guten Überblick über die Mehrheit der gedruckten Karten. Es gibt sogar einige dieser Datenbanken, die Online-Sammelkarten sind Datenbanken.
Andere Datenbanken bieten ebenfalls einen Einblick in die verschiedenen Arten von Yu-Gi-Oh! Karten und ordne diese Karten insbesondere nach Quelle oder Typ. Eine Site bietet beispielsweise eine Liste der verbotenen und eingeschränkten Karten. Eine andere Website bietet eine Liste von Karten, die nach den Sondereditionsdosen oder -packungen geordnet sind, in denen sie als Teil verkauft werden.