Es gibt viele Websites online, auf denen Benutzer ihre Yu-Gi-Oh-Karten verkaufen können: Zwei der beliebtesten Websites sind eBay und TrollAndToad.com. Auf beiden Websites können Benutzer seltene Karten als Singles und gemeinsame Karten in großen Mengen.
Während TrollAndToad.com seit 2014 Karten im Wert von mindestens 10 US-Dollar gemäß der Preisübersicht der Website verlangt, ermöglicht eBay Verkäufern, so viele oder so wenige Karten anzubieten, wie sie möchten. Der Yu-Gi-Oh-Verkaufsführer von eBay empfiehlt, Karten in großen Losen anzubieten, um die Verkaufschancen zu erhöhen. Für den Verkauf einzelner seltener Karten wie Hologramme empfiehlt eBay, Käufern Anreize wie Bonuskarten anzubieten, wenn eine Auktion einen bestimmten Preis erreicht.
