Die Quelle oder der Beginn eines Flusses liegt normalerweise in einem hochgelegenen Gebiet, beispielsweise in einer hügeligen oder bergigen Region. Mehrere verschiedene Gewässer sind mögliche Quellen für Flüsse, darunter Quellen, Seen und Moore.
Eine Quelle entsteht, wenn Wasser aus einem Grundwasserleiter überläuft, der Wasser unter dem Grundwasserspiegel speichert. Obwohl Quellen in vielen Größen vorkommen, sind große Quellen manchmal Quellen für Flüsse. Zum Beispiel wird die Themse in England von einer Quelle gespeist. Der Mississippi ist ein Beispiel für einen Fluss, der hauptsächlich von einem See gespeist wird: dem Lake Itasca in Minnesota. Moore sind eine weniger strukturierte Flussquelle, und wenn gesättigter Boden stehendes Wasser verursacht, bildet er gelegentlich einen Fluss. In bestimmten Fällen fließt Niederschlag oder Schneeschmelze bergab und bilden Fließkanäle, die in einen einzigen Fluss zusammenlaufen.