Laut HowStuffWorks.com vermehren sich die meisten Seepockenarten mit nahegelegenen Mitgliedern ihrer Sammlung durch die Verwendung männlicher und weiblicher Geschlechtsorgane oder allein, wenn keine anderen Seepocken in der Nähe sind. Die Mehrheit der Seepockenarten sind zwittrig, was bedeutet, dass sie sich nicht unbedingt miteinander paaren müssen, um sich fortzupflanzen.
Wikipedia erklärt, dass die meisten Seepockenarten sowohl männliche als auch weibliche Fortpflanzungsorgane enthalten und dadurch in der Lage sind, Eier sowie die Spermien zu produzieren, die zur Befruchtung ihrer eigenen Eier erforderlich sind, um Nachkommen zu produzieren. Diese Form der Fortpflanzung bei Seepocken gilt jedoch als sehr selten.
Ausgewachsene Seepocken sammeln sich am häufigsten und ordnen sich in dauerhaft befestigten Gruppen auf Unterwassergegenständen wie Felsen, Kais, Schiffen und sogar anderen Meerestieren an. Wenn Seepocken während der Paarungszeit nahe beieinander stehen, greifen Männchen mit funktionsfähigen Penissen aus ihren Krustenhülsen und versuchen, funktionelle, fruchtbare, eiertragende Weibchen in der Nähe zu besamen. Meeresbiologen glauben, dass Seepocken im Verhältnis zu ihrer Körpergröße die größten Penisse im Tierreich haben. Wenn die Seepocken nicht eng genug beieinander stehen, können die Männchen ihr Sperma in das umgebende Wasser abgeben, sodass die Weibchen die Möglichkeit haben, aus ihren Schoten zu greifen und die Spermien durch Einziehen in ihre Gebärmutter zu erhalten.