Eine Synapse ist die Paarung zweier Chromosomen während der Meiose. Dieser Prozess ermöglicht die Überkreuzung der Chromosomen und den Austausch von genetischem Material. Dieser Austausch führt zu einer unterschiedlichen Genetik in Organismen, die sich sexuell reproduzieren.
Eine Synapse tritt auf, wenn die Chromosomen während der ersten Phase der Meiose, die als Prophase I bezeichnet wird, ein Paar von Schwesterchromatiden bilden. Diese Schwesterchromatiden verbinden sich durch RNA- und Proteinkombinationen miteinander. Während dieses Vorgangs greifen sie ineinander und wickeln sich zusammen. Dies ist der Crossover-Prozess. Im weiteren Verlauf dieser Phase wandern die homologen Chromosomenpaare entweder zur linken oder rechten Seite der Zelle. Wenn dieser Prozess in die Anaphase I übergeht, endet die Synapse. Am Ende trennen sich die Chromosomenpaare. In späteren Phasen werden diese Chromosomen von separaten Tochterzellen aufgenommen.
Nach Beendigung der Synapse tritt die Meiose II auf. In diesem Stadium werden einige der Prozesse, die in der Meiose I mit der Synapse begannen, fortgesetzt. Die Zellen aus der Meiose I trennen sich und es werden Gameten gebildet. Diese Gameten spielen durch die Anordnung der 23 Chromosomen eine bedeutende Rolle bei der genetischen Variabilität. Dies führt zusammen mit dem Austausch genetischer Informationen während des Crossovers in der Synapse zu einer Variabilität innerhalb des Individuums.