Veränderungen, die innerhalb einer bestimmten Art auftreten, werden als Mikroevolution klassifiziert. Sie stellt eine Evolution im kleinen Maßstab dar, die durch Mutationen, Umweltfaktoren und natürliche Selektion getrieben wird und nicht zur Schaffung einer neuen Art führt.
Mikroevolution tritt innerhalb einer Art immer dann auf, wenn sich die Häufigkeit von Genen ändert. Die erhöhte Resistenz von Culex-Mücken entlang der französischen Mittelmeerküste gegenüber Pestiziden über mehrere Jahre hinweg ist ein Beispiel für Mikroevolution. Die Mücken mit Genen, die sie vor dem Insektizid schützen, überleben die Pestizidanwendung. In Gebieten, die frei von Pestiziden blieben, stieg die Zahl der Mücken, die das Gen tragen, nicht, während die Zahl der gentragenden Mücken in den besprühten Gebieten jährlich zunahm.