Linnaeus basierte sein frühes Klassifikationssystem auf den Fortpflanzungsorganen von Pflanzen, gemäß einer Geschichte von Carl Linnaeus auf der Website des Museums für Paläontologie der University of California. Die Klasse und Ordnung einer Pflanze wurden durch seine Staubblätter (männliche Organe) und seine Stempel (weibliche Organe) bestimmt. Pflanzen ohne offensichtliche sexuelle Orientierung wurden in die Klasse Cryptogamia eingeordnet, auch bekannt als "Pflanzen mit einer versteckten Ehe".
Schließlich entwickelte Linnaeus laut Education Portal ein System, das lebende und unbelebte Dinge hierarchisch kategorisierte. Sein System ging von der breitesten Kategorie zur spezifischsten in absteigender Reihenfolge. Durch das Studium der Morphologie, des Aussehens einer Kreatur, klassifizierte Linné mehr als 11.000 Organismen. Während die moderne Wissenschaft die Phylogenetik (evolutionäre Beziehungen) als Grundlage für die Organisation verwendet, gilt Linnés Werk immer noch als Grundlage der Taxonomie.
Charles Darwins Evolutionstheorie hat die Kategorisierung von Lebewesen durch Wissenschaftler verändert. Während Biologen Linnaeus bei der Einstufung von Schweinen, Stachelschweinen und Menschen in die Gattung Mammalia zustimmen, tun sie dies aus unterschiedlichen Gründen, so Understanding Evolution vom Museum of Paleontology der University of California. Während Linné versuchte, Arten nach ihrem Aussehen zu gruppieren, folgen moderne Taxonomen der Evolutionstheorie, dass die drei Arten alle vier Beine hatten und ihre Jungen aufzogen, weil sie von einem gemeinsamen Vorfahren abstammten.
